La Maestría en Ciencias en Manejo Sustentable de Recursos Naturales posee una orientación de investigación con modalidad escolarizada y su objetivo es formar profesionales calificados con conocimientos teóricos metodológicos sobre la sustentabilidad del desarrollo local, regional, nacional y global, valorando las interrelaciones de los sistemas socioecológicos y los recursos naturales, con la finalidad de generar soluciones adecuadas en torno a los territorios.

La Maestría en Ambientes Interculturales de Aprendizaje tiene una orientación profesionalizante con modalidad escolarizada cuyo objetivo es impulsar proyectos de desarrollo comunitario a través de la revaloración y recuperación de los conocimientos de los pueblos originarios en diversos ambientes: espacios, situaciones y momentos de aprendizaje.